Le CNRGV recrute un bioinformaticien !

Offre d’emploi : Bio-informaticien NGS

CDD 12 mois (renouvelable) – INRA-CNRGV

Contexte :

Localisé sur le centre INRA de Toulouse, le CNRGV est une infrastructure nationale spécialisée dans la génomique végétale qui joue un rôle clé sur la scène internationale. Ce laboratoire accompagne les programmes de recherche en génomique végétale en proposant des solutions technologiques innovantes auprès de la communauté scientifique internationale, pour répondre aux grands enjeux de la recherche agronomique. En effet, la génomique est une discipline d’importance pour mieux comprendre les mécanismes qui permettent l’adaptation et l’évolution des plantes dans un contexte environnemental donné. Le CNRGV développe notamment de nouvelles méthodes d’analyse de régions d’intérêts ciblées dans les génomes, permettant de relier un génotype à un phénotype donné.

Missions :

Le CNRGV recherche un(e) bioinformaticien qui sera intégré à l’équipe informatique pour apporter son support en bio-informatique et en bioanalyse auprès de l’équipe technique du laboratoire. Il participera notamment à l’analyse des données de séquençage de régions ciblées et à la mise en place de workflow standardisé de traitement des données issues des nouvelles technologies de séquençage. Il proposera des outils adaptés pour réaliser l’analyse des données et visualiser les résultats, notamment en recherchant des solutions permettant d’exploiter des données issues de technologies hétérogènes.
Ces missions impliquent des relations permanentes avec les membres de l’équipe, et s’effectuera sous la responsabilité du responsable informatique de l’unité.

Compétences :

  • Connaissance des principes d’analyses de données de séquençage haut débit (NGS)
  • Etre familier avec les approches bioinformatiques standard et les workflow d’analyse de données
  • Compétence en développement/scripting (R, Perl, Python, Bash)
  • Savoir évaluer la qualité des codes, la qualité des résultats et de leur interprétation
  • Savoir élaborer des jeux d’essais, d’intégrations et de tests unitaires
  • Maîtrise de l’environnement Linux et de l’anglais technique
  • Un bon background en biologie et des connaissances en statistique seraient appréciées

Profil recherché :

  • Diplôme minimum exigé : BAC +5, filière bio-informatique recommandée
  • Personne motivée, rigoureuse et dynamique
  • Bon relationnel et aptitude au travail en équipe
  • Goût prononcé pour la recherche
  • Une première expérience sur profil similaire serait un plus

Début du contrat : 2ème trimestre 2018
Durée du contrat : 12 mois (renouvelable)
Rémunération : Selon profil et expérience
Lieu de travail : Campus INRA Auzeville Tolosane - 24 Chemin de Borde Rouge - 31326 Castanet Tolosan

Les candidatures (CV et lettre de motivation) sont à adresser par mail à stephane.cauet@inra.fr et helene.berges@inra.fr

Offre d'emploi bioinformaticien