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The Long-Read Sequencing meeting

3-4 Avril 2019

Uppsala - Suède


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The Long-Read Sequencing meeting, organisé par The National Genomics Infrastructure Uppsala (NGI) est l'opportunité pour le NGI de partager les informations et son expérience concernant les applications PacBio,10x Genomics et Oxford Nanopore,et ainsi inspirer la communauté scientifique à appliquer les avancées des technologies de longues lectures de séquences dans la recherche.

Caroline Callot , Carine Satge et Margot Alison Fustier ont assisté aux présentations données par des chercheurs de différents domaines de la biologie et des sciences médicales qui utilisent un séquençage à lecture longue pour répondre à leurs questions scientifiques.

Elles ont participé à différents ateliers de travail interactifs sur différentes applications de séquençage à lecture longue, allant de la conception expérimental, préparation des échantillons, bases de bioinformatique jusqu'au possibilités d'analyse tertiaire.

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PAG XXVII logo 2019

International Plant & Animal Genome XXVII / January 12-16, 2019 - San Diego – USA

The CNRGV will attend the PAG XXVII meeting. The team will give 3 presentations and present 3 posters :


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  • PO0001 : Development of a CRISPR-Cas9 large DNA fragment targeting technique for plant genomes. Carine SATGÉ, Céline CHANTRY-DARMON, Margaux-Alison FUSTIER, Sandra MOREAU, Caroline CALLOT, Stéphane CAUET, Adrien CASTINEL, Nicolas MILON, Arnaud BELLEC, William MARANDE, Pauline DURIEZ, Stéphane MUNOS, Aurélien BANCAUD and Hélène BERGES.

Development of a CRISPR-Cas9 large DNA fragment targeting technique for plant genomes

  • PE0168 : Combining old genomic strategies with new technologies to decipher the complex structure of plant genomes. Nathalie RODDE, Carine SATGE, Céline CHANTRY-DARMON, Margaux-Alison FUSTIER, Stephane CAUET, Caroline CALLOT, William MARANDE, Sandrine ARRIBAT, Sonia VAUTRIN, Arnaud BELLEC and Hélène BERGES.

Combining old genomic strategies with new technologies to decipher the complex structure of plant genomes

  • PE0166 : Optical maps to improve our understanding of genome complexity in plants. William Marande, Sandrine Arribat, Pauline Duriez, Stéphane Muños, Ray Watson, Alex Hastie, Melis Akman, Benjamin K. Blackman and Hélène Berges.

Optical maps to improve our understanding of genome complexity in plants

 

The CNRGV will also give 3 presentations :

  • One given by Carine Satgé in the frame of the International Sunflower Sequencing Consortium to present the strategy developed in the laboratory in order to efficiently capture genomic regions of interest.
  • The second, given by Hélène Bergès, to present the interest of optical map to improve sequence genome assembly and to characterize structural variations in order to tackle intra species genetic diversity.
  • The third, given by Arnaud Bellec who presented for the first time his phD results on evolutionary dynamics of grass genomes.
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Satge-PAG-2019
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Hélène BERGES was an invited speaker at the 6th Plant Genomics & Gene Editing Congress in USA. Plant research has transformed dramatically over the last few years as a result of revolutionary breakthroughs and cost reductions in sequencing technology. Successful sequencing of many plants, along with the improvement of biological data sets, have given plant scientists the tools and knowledge to make exciting developments to benefit agriculture. Novel gene editing technologies like CRISPR will take this research even further. This conference aimed at examining the latest NGS, ‘omic’ and gene editing technologies being used for progressing plant-based research,aswell other gene-focused aspects of plant science. Hélène BERGES discussed a strategy we have developped in the laboratory in order to better characterize plant genomes. This innovative method is based on  the CRISPR-cas large fragment targeting approach,

http://www.global-engage.com/event/plant-genomics-usa/?utm_campaign=Agricultural%20Biotechnology%20Promo%20&utm_content=76839856&utm_medium=social&utm_source=twitter

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conférenciers
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helene xxelles

La Science en taille XXelles

permet à toutes & à tous de voir une exposition artistique et scientifique, de rencontrer des chercheuses & de parcourir la ville de manière inédite.

 

Dans le cadre du festival Science in the city à Toulouse, ce projet, proposé par l’association Femmes & Sciences et le CNRS Midi-Pyrénées, met en lumière des femmes scientifiques contemporaines et historiques et dévoile la diversité des métiers scientifiques et techniques pour donner envie à toutes et tous de s’intéresser aux sciences et aller à l’encontre des stéréotypes.


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C'est une exposition artistique de 12 portraits de femmes scientifiques de Toulouse, toutes disciplines confondues du 6 au 15 juillet aux Galeries Lafayette, à l'Espace des diversités et de la laïcité ainsi qu’au musée de l’aéronautique, Aeroscopia, tout l’été.

Photographe : Vincent Moncorgé ;

Direction artistique : Caroline Moncorgé-Sabatier

Et des rencontres à l’Espace des diversités et de la laïcité, 38 rue d'Aubuisson à Toulouse, du 7 au 9 juillet 2018 : de nombreuses scientifiques seront présentes pour animer des ateliers et des tables rondes, montrer la diversité des métiers scientifiques, débattre sur la science, l’égalité professionnelle, les stéréotypes, etc.

 

Teaser:  https://twitter.com/i/status/1015154509448929280

 

La science XXelles se poursuit au Quai des savoirs du 11/09/2018 au 11/06/2019

 

Toutes les ambassadrices de l’évènement de l’été 2018 « La Science taille XX elles », seront les invitées des  café du Quai des savoirs du cycle Femmes en sciences. Elles y évoqueront leur parcours, leurs travaux de recherche, leur vie de chercheuse ou d’enseignante, dans un moment convivial et riche en échanges.

Rendez-vous 39 allées Jules Guesde, entrée libre dans la limite des places disponibles.

Le cycle « Femmes en sciences » est organisé par le CNRS Occitanie Ouest et l’association Femmes & Sciences, dans le cadre des «  cafés du Quai » coordonnés par l’Université fédérale de Toulouse.

programme café quai des savoirs

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photographes xxelles
expos galeries lafayette
programme café quai des savoirs
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photo groupe xxelles
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  • P0003: Development of a CRISPR/Cas9 Large DNA Fragment Targeting Technique for Plant Genomes. Céline Chantry-Darmon, Carine Satgé, Nicolas Milon, Arnaud Bellec, William Marande, Stephane Cauet, Caroline Callot, Pauline Duriez, Stéphane Munos, Aurélien Bancaud and Helene Berges

Development of a CRISPR-Cas9 Large DNA Fragment Targeting Strategy for Plant Genome Understanding

  • P0196: Optical Maps Combined with Recent NGS Reach High Quality Genome Assembly in Plants. Sandrine Arribat, William Marande, Pierre Frasse, Pauline Heuillard, Olivier Bouchez, Mondher Bouzayen, Mohamed Zouine and Helene Berges

Optical maps combined with recent NGS reach high quality genome assembly in plants

  • P1010: Assessing the Consequences of Key Events of the Hexaploid Wheat Genome Evolution: Structural and Evolutive Analysis of an Ancestral Chromosomes Fusion Point and of a Region Resulting from Ancient and Recent Polyploidizations. Arnaud Bellec, Nadege Arnal, Nathalie Rodde, Stephane Cauet, Caroline Pont, Florent Murat, Jérôme Salse and Helene Berges.

Le CNRGV est également impliqué sur ce poster :

  • P1166 : The complete genome sequence of the parasitic weed Orobanche cumana (sunflower broomrape). Nicolas Pouilly(1), Jérôme Gouzy(1), Marie-Claude Boniface(1), Olivier Bouchez(2), Sébastien Carrère(1), Olivier Catrice(1), Stephane Cauet(3), Clotilde Claudel(4), Ludovic Cottret(1), Sebastien Faure(4), Álvaro Calderón González(5), Xavier Grand(1), Luyang Hu(1), Céline Jéziorski(3), Marc-Marie Lechat(6), Ludovic Legrand(1), Johann Louarn(1), William Marande(7), Nicolas Ribière(4), Erika Sallet(1), Philippe Simier(6), Leonardo Velasco(5), Cécile Donnadieu(2), Christophe Jestin(8), Philippe Delavault(6), Hélène Bergès(3), Marie Coque(4), Begoña Pérez-Vich(5) and Stéphane Munos(1), (1)Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes (LIPM) - INRA/CNRS, Castanet-Tolosan, France, (2)INRA GeT Genomics Facility, Castanet-Tolosan, France, (3)INRA - CNRGV, Castanet-Tolosan, France, (4)BIOGEMMA, Mondonville, France, (5)Instituto de Agricultura Sostenible - CSIC, Córdoba, Spain, (6)Laboratoire de Biologie et Pathologie Végétales, SFR 4207 QUASAV, Université de Nantes, Nantes, France, (7)French Plant Genomic Center CNRGV - INRA, Castanet-Tolosan, France, (8)Terres Inovia, Thiverval-Grignon, France

The complete genome sequence of the parasitic weed Orobanche cumana (sunflower broomrape)

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Centre Pierre Baudis

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June 4th, 2014 - Toulouse, France  /  Achievements, challenges and future for  plant genomics

 The French Plant Genomic Resource Center (CNRGV) was created 10 years ago by the INRA based on a French ministry decision. The aim of this new structure was to maintain and valorize genomic resources developed at that time in the framework of first plants genomic large-scale projects. During the past decade the CNRGV has developed its activity, offering more and more resources and new technical services following the goal to meet the needs of the plant genomic community and support their efforts.

Centre Pierre Baudis

To celebrate our tenth anniversary we want to take the opportunity to look back at the contributions of genomics in plant research and to imagine the future.

 Thus we are very pleased to invite you to attend the Plant Genomes' Day which will take place in Toulouse on June 4th, 2014.

During this day, scientists who played a major role in the development of plant genomics will present several major projects and share their points of view regarding the future and expectations. In addition to the opportunity to attend fascinating conferences, we will also take time to exchange.  The conference will be followed by a friendly social event.

 
Confirmed speakers : 

Vincent Colot - CNRS - France

Patrick Schnable - Iowa State University - USA

Kellye Eversole - Eversole Associates - USA

Nils Stein - IPK - Germany

Michele Morgante – IGA - Italy

Cristobal Uauy – JIC - UK

Christophe Plomion  - INRA - France

Rajeev Varshney – ICRISAT - India

Francis Quétier  - University of Evry – France

Rod Wing – AGI – USA

Jane Rogers - IWGSC - UK

Nevin Young – University of Minnesota – USA

 

Program available : Program

Watch all Plant Genomes' Day conferences in video here !