Après un séjour de 3 semaines en juin 2021 pour se former aux méthodes d’extraction d’ADN de haut poids moléculaires pour la production de carte optique, Dorita Galea, de l’Université de Malte, est revenue trois jours au CNRGV pour approfondir ses connaissances concernant le traitement des données génomiques.

Dorita travaille à l’Université de Malte, sur deux espèces d’une plante endémique de l'île, le Limonium.

Nous avons partagé avec elle notre expertise afin qu’elle puisse réaliser en autonomie l’analyse des données de cartes optiques et de séquençage PacBio.

Charlotte Cravero, bioinformaticienne au CNRGV, a formé Dorita à l’assemblage des séquences.

Nathalie Rodde, spécialiste de la production de cartes optiques, lui a expliqué comment traiter ces données pour produire les cartes optiques d’un génome.

Le CNRGV accueille régulièrement des étudiants et des chercheurs intéressés par le domaine de la génomique végétale, dans le cadre de projets collaboratifs. Si vous êtes intéressés par ce type de séjour, n'hésitez pas à nous contacter.